市政工程施工总承包资质证书的有效期一般为5年。

不过，还需注意的是，各地区可能会根据当地实际情况对资质有效期及相关政策进行调整。例如，福建省住房和城乡建设厅发布的关于建设工程企业资质延续有关事项的通知（闽建许〔2023〕4 号）规定，资质证书有效期于2023年12月31日前和2024年12月31日前届满的，统一延期至2024年12月31日。在延长后的有效期届满前三个月，企业应按资质管理有关规定向原资质审批部门申请资质延续（企业通过合并、跨省变更事项取得有效期1年资质证书的，不适用该规定，应在1年资质证书有效期届满前，按相关规定申请重新核定）。

另外，住房城乡建设部办公厅于2023年12月28日发布的《关于做好有关建设工程企业资质证书换领和延续工作的通知》（建办市〔2023〕47 号）提出：
- 对于《国务院关于深化“证照分离”改革进一步激发市场主体发展活力的通知》（国发〔2021〕7 号）决定取消的建设工程企业资质，企业可在资质证书有效期届满前换领有效期1年的相应专业资质证书（工程勘察设计丙级、丁级资质换领相同专业乙级资质证书，施工总承包、专业承包三级资质换领相同专业二级资质证书，有关工程监理企业资质按《已取消的工程监理企业资质证书换领对照表》换领相应专业等级资质证书）。资质证书有效期届满前未申请换领相应资质证书的，逾期自动作废。取得有效期1年资质证书后，企业应在该资质证书有效期届满前，按有关资质管理规定和资质标准申请延续。
- 施工总承包一级资质、专业承包一级资质企业，资质证书有效期于2024年9月15日前届满的，企业申请延续时，可选择申请资质证书延续5年有效期或1年有效期。申请1年有效期资质证书的，暂不对企业的注册建造师等进行核查。企业应在资质证书1年有效期届满前，按有关资质管理规定和资质标准申请延续，经核查合格的颁发5年有效期资质证书。资质证书有效期届满前未申请延续的，逾期自动作废。

建议关注当地住房城乡建设主管部门的相关政策通知，以确保企业的资质证书持续有效。同时，企业应在资质证书有效期届满前，按照相关规定及时申请延续或换领证书，以免影响企业正常承接市政工程项目。